あてつけのような言い方はまずかったですね…。
先輩と比較した事で、彼のプライドを傷つけてしまいました。
挽回するのはかなり難しいです。

今回の事に限らず、分からない事があったら
自分から素直に、直接的な言い方で確認した方がいいですよ。
好きな人だけでなく誰が相手でも、そういう確認方法は
人間関係を円滑にするために必要です。

まずは、みなみさんが彼の立場になってみて
先輩と比べられたらどんな気持ちになるか想像してみて下さい。
そのうえで、真摯に謝罪をしましょう。
よくわからない関係だったからなんて言い訳して
「私は悪くない。むしろ貴方に責任がある」みたいな態度をとるから
幻滅されてしまったのです。
誠意が伝わり謝罪を受け入れてもらえれば、関係修復の可能性は高まります。

あとは、お互いに蒔いた種ですから
仕事のやりにくさは割り切るしかないです。
社内恋愛のデメリットが、もろに出る形になっただけで
お付き合い中に喧嘩した時にも発生する問題です。

公私を分けられない方は、社内恋愛には向いていません。
今は練習と思って、ビジネスライクでもいいので
挨拶と笑顔、ほうれんそうで連携をとって、少しでも仕事がやりやすくなるよう
みなみさんから行動してみて下さいね。