卒業後の進路は彼と同じですか？
バレたくないというのは、彼にですか？
主さんはなぜ彼に気持ちを伝えたいと思っているのですか？
伝えたいと思っているのになぜ匿名なのですか？

私は主さんの前の投稿を見ていないので詳しいことはわかりませんが、匿名でのラブレターは相手にもよく思われないでしょうし、名前を出してしっかり気持ちを伝えた方が主さんのためにもなるかと。当たって砕けろ精神です。
きっと匿名で気持ちを伝えても『あの時の反応はどうだったかな？』『ちゃんと伝わったかな？』と暫くは引きずって、ちゃんと相手に「私があなたを好き」と伝えればよかったと後悔する日が来ます。伝えられる機会があるのなら、最大限勇気を出して伝えましょう。中途半端な勇気なら伝える意味ないかと思います。

匿名だと、渡されても気分良く無いだろ。
　名前書く勇気ないなら、出すな。
　出すなら郵便で良くない？
　学校内で受渡ししたいん？担任の先生に頼めば？
　キッパリ勇気出して本人の前に立って「コレ読んで」って渡したら？

既婚男性です。

匿名の手紙を密かに設置することに意味はありますか？

彼は周りに話すだろうし、周りには悪戯だよ、と言われて終わりです。

ただし、○○日〇〇時に○○で待ってます、という形式なら意味があります。

ただし、彼が人に話して人が集まって傷つく可能性もありますから、

密かに確認して、彼一人で来たなら姿を現し、複数いるようだったら現さずに悪戯で終わらせる。

という方法もあります。

それでも、彼１人に傷つけられる可能性は残っていますが、さすがにそれなら諦めがつくでしょう。

＞どこに置けば先生や他の人にバレずにみてもらえるでしょうか？

昔からあるのは下駄箱の中、しかしこれは蓋つきの下駄箱でないとダメ。

その場合は教室のロッカーですが、彼１人だけの時にみつけない限り、

なんだこりゃ、てな感じで傍にいた人に知られるのは避けられません。

ですから事実上不可能かと。

本人限定受け取りで郵便物として出した方がまだマシか。